La compensazione degli importi che l'operatore deve corrispondere al GSE per regolarizzare la sua posizione amministrativa può essere parziale o totale e viene applicata ai rapporti contrattuali con il GSE.
Nel primo caso, l'importo totale dovuto al GSE non viene recuperato totalmente perché gli importi a favore dell'operatore, utilizzati per la compensazione, sono inferiori al credito vantato dal GSE.
Nel secondo caso, invece, l'importo totale dovuto al GSE viene totalmente recuperato perché gli importi a favore dell'operatore, utilizzati per la compensazione, sono uguali o superiori al credito GSE.
Gli importi utilizzati per la compensazione possono essere legati a più contratti dello stesso servizio o a più contratti di servizi differenti.